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  • 阅读: 2022/8/10 8:43:19

    在展示和比较数据(比如基因的表达量、物种的丰度等)分布情况的时候,除了最为常见的箱形图和小提琴图,我们也可以试试其他更为新鲜一点的展示方法。之前在《高分文章中那些“飘逸”的曲线图如何绘制?》一文已为大家介绍过如何使用R语言绘制好看的核密度曲线图,这里再为大家介绍一种看起来更加炫酷的一种作图方法,作图效果如下。

    作图方法其实比较简单,无需编程,简单几步就可出图。下面就以具体的范例数据,看下如何绘制吧!

    数据准备

    首先,打开Origin2021)软件,将范例数据直接复制粘贴到Origin的表格中,具体样式如下。

    图表绘制

    接着通过Plot/Statistical/Distribution+Rug绘制分布曲线图,如下图。

    在弹出的Plot Setup窗口选择数据与图形的映射关系,Plot Type(图表类型)选择Histogram,图表的Y坐标对应数据表格的ABC列,点OK键按钮开始绘图。

    图形调整

    双击图表的图形区域,在Plot Details窗口的Distribution选项中可以设置分布曲线的配色方案,勾选Fill to Bottom在密度曲线下方添加填充颜色,将填充颜色(Fill)与描边颜色(Color)改为完全相同,Fill Transparecy(透明度)改为50%

    调整颜色后的图表如下:

    直接双击坐标轴(X轴),可以调坐标轴整数值的范围,在坐标轴属性调整窗口中的Rug选项中,可将密度线(竖线)的粗细(Thickness)改为0.5,然后将透明度改为50%Layout(密度线窗口)的Size改为40,取消勾选Overlap,并将Gap Between Rugs%)改为5Margin%)也改为5

    调整后的效果如下:

    当然,如果觉得曲线不够光滑,也可以试试其他的曲线类型(默认为Kernel Smooth),比如改为Normal(正态密度曲线),如下。

    调整后的效果如下,接着只需选中图例,将字号调小,将图例的黑色线框调为白色即可。

    调整满意后,通过File菜单下的Export Graphs命令导出所需格式的图片。

    转自:基迪奥生物

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