SCI文章中的棒棒糖图如何使用R语言绘制？

• 阅读： 2022/11/29 9:44:36

  以下文章来源于Paper绘图 ，作者超级super栋

  背景介绍

  棒棒糖图，其实就是一个垂线图，目前使用的人还比较多。该图形打破传统的柱状图的形式，采用散点和垂线结合，形状看起来像棒棒糖一样。在一些SCI文章中还比较多，我们今天来使用R语言来实现一下。

  软件介绍

  R

  RStudio

  绘图教程

  1. 打开RStudio，我们首先加载需要的包。一般我会直接加载tidyverse，这是一个数据处理和绘图的包的集合，基本上加载了这个，数据处理绘图都可以了。

  # 加载包

  library(tidyverse)

  2. 我们构建一个数据框用于进行绘图。

  data <- data.frame(

  name=c("n_a","n_b","n_c","n_d","n_e"),

  value=c(2.1,2.3,3.2,2.9,4.5))

  3. 使用ggplot包进行绘图。

  采用geom_point()进行散点的绘制；

  采用geom_segment()进行直线的绘制，事实上，该函数是用来绘制矩形的，因此这里x和xend是相同的，只改变y的值。

  ggplot(data,aes(name,value))+

  geom_point()+

  geom_segment(aes(x=name,xend=name,y=0,yend=value))

  4. 进一步，我们对图形进行美化。

  对图形的点进行更改，包括颜色，透明度；

  对线进行更改，包括颜色，线型，粗细。

  ggplot(data,aes(name,value))+

  geom_point(size=5, color="red", fill=alpha("orange", 0.3),

  alpha=0.7, shape=21, stroke=3)+

  geom_segment(aes(x=name,xend=name,y=0,yend=value),

  size=1, color="blue", linetype="dotdash")

  5. 最后，对主题和标签进行美化即可。

  ggplot(data,aes(name,value))+

  geom_point(size=6, color="red", fill=alpha("orange", 0.3),

  alpha=0.7, shape=21, stroke=3)+

  geom_segment(aes(x=name,xend=name,y=0,yend=value),

  size=1.5, color="blue", linetype="dotdash")+

  theme(panel.background = element_rect(fill="#F0E9D2",colour = "black",size = 2),

  text = element_text(size=18))

  6. 当然，你也可以将横纵坐标翻转。

  ggplot(data,aes(name,value))+

  geom_point(size=6, color="red", fill=alpha("orange", 0.3),

  alpha=0.7, shape=21, stroke=3)+

  geom_segment(aes(x=name,xend=name,y=0,yend=value),

  size=1.5, color="blue", linetype="dotdash")+

  theme(panel.background = element_rect(fill="#F0E9D2",colour = "black",size = 2),

  text = element_text(size=18))+

  coord_flip()

  7. 好了，赶紧来学习一下吧！

  转自：“投必得学术”微信公众号

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